Az erdőökológiai munkacsoport elsősorban bükkösök hosszú távú erdődinamikai vizsgálatát végzi. Több erdőrezervátumban is folytat erdőszerkezeti, faállomány-szerkezeti, botanikai, erdőtermészetességi, erdő- és mohaökológiai kutatásokat, közreműködnek a kutatás-módszertan kidolgozásában és fejlesztésében.